多抗親和層析純化
多抗的純化是一件比較簡(jiǎn)單的事情,因?yàn)槿斯じ深A(yù)比較大,所以對(duì)實(shí)驗(yàn)者的操作依賴性較強(qiáng)。很多新手覺(jué)得這是一件比較復(fù)雜困難的工作,但是如果理解了原理,就可以自行改進(jìn)實(shí)驗(yàn)了。多抗純化方法比較多,過(guò)去有用鹽析法純化的,有用辛酸-硫酸銨沉淀的方式純化的,也有用冷酒精沉淀的方式純化的,也有后來(lái)的離子交換層析和Protein A、G、A/G 純化的,但是在今天,市場(chǎng)上幾乎所有的抗體都是通過(guò)抗原親和純化得到的,與其它方法相比,抗原親和層析得到的抗體效率高、產(chǎn)量高、產(chǎn)品純、操作簡(jiǎn)單。鑒于很多網(wǎng)友問(wèn)起這方面的問(wèn)題,我就詳細(xì)地講一講親和純化原理和操作。
說(shuō)到親和層析,還得從上個(gè)世紀(jì)60年代說(shuō)起。當(dāng)年美國(guó)NIH(National Institutes of Health)
有個(gè)學(xué)生在研究一種酶和抑制劑之間的相互作用的時(shí)候,突發(fā)奇想:既然此酶可以和抑制劑結(jié)合,那如果把抑制劑固定起來(lái),不就可以用來(lái)純化酶了嗎?試了一下覺(jué)得果然可行于是發(fā)了論文,從那之后,就出現(xiàn)了各種各樣的親和層析,親和配基與配體可以是酶與底物、酶與抑制劑、激素與受體、抗原和抗體、糖蛋白與凝集素、生物素與親和素、組氨酸與二價(jià)金屬離子、卟啉環(huán)與亞鐵離子等。親和層析精髓:將一種分子固定,用來(lái)吸附另一種特異性分子,最后將其洗脫下來(lái)。
言規(guī)正傳,多抗的親和層析是基于抗原與抗體結(jié)合的一種層析方式。基本思路是將抗原固定在一種基質(zhì)(也就是柱的填料,大家都叫介質(zhì)或beads)上,然后與抗血清孵育以捕獲相應(yīng)的抗體,然后從基質(zhì)上洗掉非特異性結(jié)合的抗體,最后再將抗體洗脫下來(lái)。一個(gè)經(jīng)典的親和純化流程如下:
(1)介質(zhì)的制備目前大部分親和柱介質(zhì)都是基于瓊脂糖(Agarose)或者葡聚糖(Dextran)。由于瓊脂糖穩(wěn)定性好、對(duì)蛋白質(zhì)的非特異性吸附低、適宜活化,因此是制備抗原親和柱介質(zhì)的理想材料。單純的瓊脂糖是不能和蛋白質(zhì)直接相連的,因此需要給它加一個(gè)有活性的臂,這就有點(diǎn)類似多肽與載體蛋白的偶聯(lián)需要一個(gè)雙功能試劑一樣。瓊脂糖加臂(活化)的方法比較多,其中涉及的原理也和多肽與載體蛋白偶聯(lián)類似,最常用的活化試劑是溴化氰和環(huán)氧氯丙烷,另外二溴丙醇、N,N'-羰基二咪唑、雙環(huán)氧化物等也可以用來(lái)活化瓊脂
糖。
溴化氰對(duì)瓊脂糖的活化機(jī)理如下:
環(huán)氧氯丙烷活化機(jī)理如下:
關(guān)于如何操作的問(wèn)題,可以參考文獻(xiàn)。如果你想自己制備,為了你和他人的安全,請(qǐng)不要使用溴化氰活化,溴化氰有劇毒,極微量的攝入都有可能造成死亡,本人對(duì)此類事故不負(fù)任何責(zé)任。如果是單純做一次或幾次小量抗原親和純化,建議購(gòu)買商品化的介質(zhì),GE Healthcare 就有賣的(Cat. NO.為17-0430-01)。以下的介紹就基于此介質(zhì)說(shuō)明書展開(kāi)敘述的。使用此種介質(zhì)首先需要將其進(jìn)行預(yù)處理,預(yù)處理方法是:稱取適量的介質(zhì)(一般0.5g介質(zhì)可以一次性純化10ml 左右血清,可以反復(fù)使用)倒入pH 2.0 HCl 中,4℃讓其吸脹15min,體積膨脹比例為:1g 可以膨脹至3.5ml,然后將其裝入漏斗中,用pH2.0 HCl 充分洗滌(體積為介質(zhì)膨脹后的50倍以上)以除去保護(hù)劑。千萬(wàn)不可用中性或堿性試劑洗滌,否則介質(zhì)會(huì)水解。
(2)抗原與介質(zhì)的連接這一步是整個(gè)純化過(guò)程中最關(guān)鍵的一步,如果在這一步上有什么失誤,建議你從第一步重新開(kāi)始吧。首先要注意一點(diǎn):常見(jiàn)的連接方法都基于抗原上的游離氨基或者巰基與活化后的介質(zhì)的連接,因此體系中不應(yīng)該有其它含有氨基或巰基的化合物,包括尿素、硫脲、鹽酸胍、Tris、銨根離子、β-巰基乙醇等,如果有這些物質(zhì)在體系中,應(yīng)該首先設(shè)法除去。
溴化氰活化的瓊脂糖與氨基化合物反應(yīng)的機(jī)理如下:
環(huán)氧氯丙烷活化的瓊脂糖與氨基化合物反應(yīng)的機(jī)理如下:
連接反應(yīng)進(jìn)行的條件:① 緩沖體系。上述兩個(gè)連接反應(yīng)都應(yīng)該在堿性環(huán)境下進(jìn)行。pH宜在8-10之間,推薦使用Na2CO3-NaHCO3體系,pH 盡量偏離蛋白的等電點(diǎn),但不可高于10,否則介質(zhì)很容易水解。pH 也不能過(guò)低,否則抗原的氨基或巰基會(huì)被質(zhì)子化,無(wú)法與介質(zhì)結(jié)合。也可以考慮用其它的緩沖體系,但是絕對(duì)不可引入帶有游離氨基或者巰基的化合物。為了防止蛋白類抗原的聚集,體系中還可以加入0.5M NaCl 以提高鹽離子濃度。② 蛋白質(zhì)濃度。為了達(dá)到比較快而且比較徹底的反應(yīng),抗原濃度應(yīng)盡量提高(也就是高中課本上講的勒沙特列原理),但過(guò)高的濃度有可能造成聚集形成沉淀。一般推薦濃度是5-10mg/ml。需要注意的是介質(zhì)的承載量并沒(méi)有這么大。用來(lái)連接的蛋白在緩沖體系中必須完全溶解,如果不能溶解可以嘗試加入去垢劑,多肽等小分子化合物可以用DMSO、DMF、二氧六環(huán)助溶。③ 反應(yīng)溫度與時(shí)間。此反應(yīng)可以在室溫進(jìn)行,一般來(lái)說(shuō),室溫4小時(shí)反應(yīng)足夠完成,如果擔(dān)心抗原降解,可以在4℃進(jìn)行,需要過(guò)夜反應(yīng)。
(3)連接效果的評(píng)估有經(jīng)驗(yàn)的同仁這一步基本可以不做,但是對(duì)于新手來(lái)說(shuō)做了這一步心里更有譜一些。這個(gè)過(guò)程盡量用比較簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)來(lái)做比較好,推薦使用考馬斯亮藍(lán)法(Bradford 法),但是體系中如果含有去垢劑,建議改用其它的方法(如BCA、Lowery、凱氏定氮法等),也可以取連接后的上清液(離心后)拿去做SDS-PAGE 判斷。確認(rèn)連接沒(méi)有問(wèn)題后,以將體系轉(zhuǎn)入柱子里除去連接后的液體,如果沒(méi)有柱子,也可以用離心的方法進(jìn)行,下同。
(4)多余位點(diǎn)的封閉為了保證連接效率,介質(zhì)的量通常是過(guò)量的,因此連接完后,介質(zhì)上就有很多多余的空位點(diǎn),如果不把它們封閉,那接下來(lái)的一步里就會(huì)與血清中的抗體結(jié)合,這樣就會(huì)影響抗體得率。含有氨基的小分子化合物都可以用來(lái)進(jìn)行封閉,如尿素、Tris、乙醇氨、單一氨基酸等,大分子物質(zhì)是不適宜用來(lái)封閉的,因?yàn)樗鼈兊目臻g位阻會(huì)影響下一步中抗體與抗原的結(jié)合。封閉條件與連接條件基本類似。封閉完成后,除去封閉液,用PBS洗柱三次。
(5)抗血清與介質(zhì)的結(jié)合血清事先經(jīng)過(guò)10000g 離心5min,有條件的還可以通過(guò)0.45μm濾膜過(guò)濾。將血清用PBS 稀釋一倍,然后加入連好抗原的介質(zhì),密封好,4℃搖晃過(guò)液或者室溫?fù)u晃3至4小時(shí),搖晃時(shí)最好能顛倒來(lái)回?fù)u動(dòng),確保所有介質(zhì)都能懸在液體中。室溫孵育時(shí)間不宜過(guò)長(zhǎng),否則會(huì)引起非特異性吸附,同時(shí)影響抗體質(zhì)量。
(6)非特異性結(jié)合的抗體的洗滌第5步完成后,過(guò)柱或者離心去掉血清成份,用PBS洗滌三次。然后再用一個(gè)稍稍Harsh 一點(diǎn)的體系去洗掉與抗原非特異性結(jié)合的蛋白,怎么樣的體系算是比較Harsh 呢? 一種是偏酸或偏堿一點(diǎn)的pH,可以加酸或加堿將PBS 或生理鹽水的pH 調(diào)至偏酸(5.0)或偏堿(8.5)作為洗滌液,用10倍柱體積洗柱一次,也可以直接用150mM Gly,基本不用調(diào)pH 就是pH=5.0了。另一種體系是高鹽離子濃度,例如可以在PBS 里加入NaCl 至終濃度為1M,10倍柱體積洗滌一次。兩種體系的本質(zhì)都是減弱蛋白質(zhì)分子間的作用力。
(7)洗脫經(jīng)過(guò)第6步的操作后,結(jié)合在柱上的抗體就非常純了,同時(shí)那些親和力弱的抗體也被洗掉,于是可以開(kāi)始洗脫了。洗脫方法和上面的洗滌原理基本類似,只是條件更苛刻一點(diǎn)。通常用得比較多的辦法是用pH 2.5左右的HCl(含150mM NaCl)洗脫,也可以采用堿性洗脫液洗脫。洗脫有兩種方式,一種是連續(xù)洗脫,另一種是不連續(xù)洗脫。前者是連續(xù)入加洗脫液,即時(shí)監(jiān)控洗脫情況并隨時(shí)決定收集目的抗體組分。不連續(xù)洗脫則是分批加入洗脫液,分批收集洗脫流出的成份,最后再對(duì)每一次收集的組分檢測(cè)。如果用前一種方法,最好有一臺(tái)紫外監(jiān)測(cè)儀檢測(cè)流出組分以便即時(shí)監(jiān)控,后一種方法的檢測(cè)則相對(duì)比較簡(jiǎn)單一些,只要是可以對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量的方法都可以使用(如Bradford 法、Lowery 法、BCA 法等都可以),總之就是越簡(jiǎn)單越好。洗脫過(guò)程盡里在低溫完成,洗脫下的組分應(yīng)該在冰盒上放置,洗脫下來(lái)后的成份應(yīng)該立即調(diào)節(jié)pH 至中性,調(diào)節(jié)pH 應(yīng)該使用緩沖液,而不應(yīng)該直接使用強(qiáng)酸或強(qiáng)堿,Na2HPO4、Na2CO3和Tris 等緩沖液是用來(lái)作為中和液的不錯(cuò)選擇。需要指出的是,如果需要將抗體進(jìn)行偶聯(lián)熒光素或者酶的時(shí)候,就不能使用Tris 作為中和液,否則會(huì)影響后面的邊接效率。
(8)抗體的保存抗體純化完后,必須采取合適的保存,否則很容易就失去活性。總的來(lái)說(shuō)有這么幾個(gè)方面需要注意:① 緩沖體系。純化后的抗體必須處于一個(gè)相對(duì)接近體液的緩沖體系中,一般的PBS 體系就足夠了。注意不要引入高濃度的離子,尤其是金屬離子。不要引入干擾抗體實(shí)驗(yàn)的離子或基團(tuán)。② 防腐劑。為了防止抗體長(zhǎng)菌,必須加入防腐劑,常見(jiàn)的防腐劑有:疊氮鈉、硫柳汞、抗生素(慶大霉素)。疊氮鈉的常用濃度是0.02%,硫柳汞和慶大霉素的常用濃度為0.01%,其中疊氮鈉會(huì)抑制HRP 酶活性,因此在需要偶聯(lián)HRP酶的抗體中不能加這種防腐劑,而且疊氮鈉會(huì)影響細(xì)胞色素氧化酶活性,會(huì)干擾機(jī)體的呼吸作用,因此操作時(shí)需要注意安全。硫柳汞對(duì)兒童具有潛在毒性,使用時(shí)也應(yīng)注意。③ 穩(wěn)定劑。向抗體中加入穩(wěn)定劑可以增加其穩(wěn)定性,常見(jiàn)的穩(wěn)定劑有多羥基類化合物(二元醇、三元醇等,如濃度為30%-50%的甘油、乙二醇)、二糖類物質(zhì)(如蔗糖、海藻糖等)、氨基酸、蛋白質(zhì)(如BSA 等),如果抗體需要進(jìn)行標(biāo)記,則不可以加入氨基酸、BSA 等保護(hù)劑。④溫度。長(zhǎng)期不用時(shí),抗體應(yīng)該低溫保存,一般采用-20℃保存。短期不用可以放在4℃,但不要超過(guò)一周。抗體絕對(duì)要避免反復(fù)凍融,前面提到的加入甘油等既可以起穩(wěn)定作用,還可以起防凍的作用。如果有條件,可以把抗體進(jìn)行冷凍干燥形成凍干粉,放在-80℃。如果抗體尚未純化,直接以血清的方式保存在-20℃以下,也可以很好地保證其活性。⑤ 濃度。和普通蛋白質(zhì)一樣,濃度越高就越利于保存。如果抗體濃度太低,可以采用超濾、protein A 或Protein G(操作方法參考單抗純化相關(guān)介紹)、透析袋等方式濃縮。超濾的方式操作簡(jiǎn)單,直接將抗體裝入超濾管再進(jìn)行離心即可。透析袋濃縮操作也比較簡(jiǎn)單,將PEG(分子量大于8000)配成50%左右的溶液,用合適孔徑的透析袋裝好抗體,然后放入PEG 溶液中攪拌濃縮即可。關(guān)于Protein A 或Protein G 濃縮的方法將在單抗純化相關(guān)部分講述,需要指出的是這用這兩種親和柱濃縮的損失可能比較大。⑥ 存儲(chǔ)時(shí)間。抗體在-20℃并含有甘油的情況下可以存放數(shù)年至十幾年(不要反復(fù)拿至溫室)。在4℃存放的時(shí)間一般在一個(gè)月左右就可以有明顯的效價(jià)變化。冷凍干燥的凍干粉低溫可放置幾十年。